コーヒーは適量の摂取によって多くの健康上のメリットが得られる。代表的な効果を下表に示す。ただし、コーヒーの飲みすぎは不眠、胃の不調、心拍数の増加などの副作用を引き起こす。個々の情況に合わせて適度に摂取することが大切。

コーヒーの健康効果
アンチアイジング抗酸化作用や体内の代謝促進により、細胞保護と修復、炎症の抑制、血液循環の改善などで老化を押さえる。
抗酸化作用ポリフェノールやクロロゲン酸といった抗酸化物質が豊富に含まれ、細胞の老化や酸化ストレスから体を守る。
脳機能の向上カフェインは注意力や集中力を高める働きがあり、また適量のコーヒー摂取はアルツハイマー病やパーキンソン病のリスクを減らす。
心血管の健康適度なコーヒー摂取は血管の健康を保つ助けとなり、一部の研究では心血管疾患のリスクを低減する可能性が示されている。
糖尿病予防毎日適量のコーヒーを飲むことで、2型糖尿病の発症リスクを抑える可能性がある。
肝臓の健康コーヒーは肝臓を保護し、慢性肝疾患や肝硬変のリスクを減少させる可能性がある。
運動効果の向上カフェインにはエネルギーの増加や運動能力の向上に役立つ効果があり、スポーツの際のパフォーマンスを向上させる。

コーヒーの焙煎方法は、アンチエイジング効果に大きく影響する。浅煎りのコーヒー豆は、ポリフェノールの一種であるクロロゲン酸を多く含む。クロロン酸は強力な抗酸化作用を持ち、肌の老化防止や細胞の酸化ストレス軽減に役立つ。 深煎りではクロロゲン酸の量が減少するが、代わりにニコチン酸（ビタミンB3）が増加する。ニコチン酸は細胞修復を助け、老化の進行を遅らせる効果が期待される。

焙煎度の選び方として、アンチエイジング効果を最大化したい場合は深煎りが良い。焙煎が進むほどカフェインの含有量が減少する傾向があるため、リラックス効果を求める場合は浅煎りを選ぶのが良い。

コーヒー豆は輸送時にアフトラキシン防止のため防カビ剤が使用されることが多い。コーヒー豆は多孔質であるため防カビ剤が内部に残留しやすく健康に有害となる可能性がある。これを防ぐには有機認証がある豆を選ぶのが望ましい。